1時間だけ研修で抜けるなどの設定はできますか？

設定可能です。
研修として、下記のように設定ができます。

園での勤務時間：7:30〜17:00
研修時間：14:00〜15:00

研修時間は勤務時間としてカウントされますが、配置基準にはカウントされません。