打刻漏れの申請は、招待登録を受けた保護者でもできますか。

はい。
招待されて保護者として登録した方でも、打刻漏れの申請が可能です。
（例えば、1人の園児に母・父・祖母が保護者として登録していた場合、3人のどなたかが申請を行えば良い）